Pianista, maestro, arranjador, professor e compositor, Amilson Godoy atuou como solista de prestigiados grupos instrumentais e esteve à frente de diversas orquestras sinfônicas do Brasil.
A partir de 1964, ganhou projeção com o grupo Bossa Jazz Trio, com o qual excursionou por diversos países das Américas e da Europa. Em 1967 e 1968, o Bossa Jazz Trio, entre várias turnês, esteve com Elis Regina em seu lançamento na Europa, no Festival Midem de Cannes e em sua primeira temporada no consagrado Teatro Olympia de Paris.
Posteriormente, à frente do Quinteto Amilson Godoy, levou a música popular instrumental a diversas cidades brasileiras. De 1981 até 1984, integra o Grupo Medusa, um dos ícones da nossa música instrumental. Com o grupo, além de várias turnês pelo Brasil, Amilson se apresentou no 3º Festival de Jazz de Paris.
Recebeu, em 1984, o prêmio de melhor arranjador no 26º Festival Internacional da Canção de Viña del Mar – conquista até então inédita para um brasileiro. Dentre suas muitas parcerias, Amilson se apresentou como instrumentista com Toquinho, Dominguinhos, Ray Conniff, Fafá de Belém e, como solista de música erudita, da Orquestra Filarmônica de São Paulo, Orquestra Sinfônica do Teatro Nacional de Brasília, Orquestra da Universidade Federal Fluminense, entre outras.
Amilson também tem grande atuação no campo da educação musical. Como coordenador da Escola de Música da Fundação das Artes de São Caetano do Sul (1970-1980), trouxe a música popular para o ensino acadêmico, criando um modelo de aprendizado que é seguido até hoje pelas escolas especializadas de música. Como presidente das entidades UBM (União Brasileira dos Músicos) e ASSIM (Associação de Intérpretes e Músicos), defendeu os interesses dos músicos, conquistando os direitos conexos e o direito do arranjador, para os músicos brasileiros. Foi também responsável pela direção musical de inúmeras peças teatrais, shows e programas de TV, entre eles, a primeira versão no Brasil de Vila Sésamo.
Em 1993, Amilson criou a Orquestra Sinfônica Pop Arte Viva, onde atua como regente titular e arranjador, se apresentando pelo Brasil em concertos como Forró Sinfônico, Rock Sinfônico e MPB Sinfônico e cuja proposta é atrair o grande público para a música sinfônica, através da música popular.